Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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