Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NR5A1Q13285 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NR5A1Q13285 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms