Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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IFT88Q13099 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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IFT88Q13099 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT88Q13099 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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