Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN1Q04323 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms