Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDR2Q01850 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms