Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM3AP98173 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM3AP98173 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms