Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms