Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAEP38570 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAEP38570 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms