Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFNP31947 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFNP31947 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFNP31947 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms