Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms