Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNNI3P19429 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms