Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CCL3L1P16619 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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