Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEFHP12036 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms