Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LSINCT5-201ENST00000626215 2647 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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LINC00587B1AMM8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00587B1AMM8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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