Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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