Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DKK3Q9UBP4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms