Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC22A11Q9NSA0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms