Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX15Q9NRS6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX15Q9NRS6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms