Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms