Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMBRA1Q9C0C7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms