Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXQ1Q9C009 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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