Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCGF6Q9BYE7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms