Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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IFT27Q9BW83 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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IFT27Q9BW83 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFT27Q9BW83 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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