Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APOL4Q9BPW4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APOL4Q9BPW4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms