Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHDQ96IW2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms