Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MVB12AQ96EY5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms