Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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COPS9Q8WXC6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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COPS9Q8WXC6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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COPS9Q8WXC6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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COPS9Q8WXC6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
COPS9Q8WXC6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
COPS9Q8WXC6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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