Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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