Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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TTC29Q8NA56 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TTC29Q8NA56 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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TTC29Q8NA56 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TTC29Q8NA56 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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