Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC84Q86UT8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms