Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VITQ6UXI7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms