Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHDC7AQ5VTJ3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms