Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LCN1P1Q5VSP4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms