Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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