Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDCD2Q16342 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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