Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA6Q15825 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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