Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRADDQ15628 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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