Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCM1Q15154 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms