Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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