Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 BANF1-204ENST00000524663 251 ntTSL 39.89□□□□□ -0.833e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CAMTA1-213ENST00000490738 538 ntTSL 233.11■■■□□ 2.894e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.884e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.64e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CAMTA1-209ENST00000476163 863 ntTSL 223.33■■□□□ 1.334e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.294e-8■□□□□ 11.2
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PABPC4Q13310 CAMTA1-206ENST00000470648 766 ntTSL 311.52□□□□□ -0.574e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.774e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CAMTA1-207ENST00000472283 384 ntTSL 310.08□□□□□ -0.84e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CAMTA1-203ENST00000461580 826 ntTSL 39.78□□□□□ -0.844e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CAMTA1-202ENST00000461311 431 ntTSL 24.93□□□□□ -1.624e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CAMTA1-212ENST00000486138 392 ntTSL 24.87□□□□□ -1.634e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.459e-46■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPT1-208ENST00000527226 613 ntTSL 216.62■□□□□ 0.259e-46■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 TPT1-207ENST00000490277 1851 ntTSL 210.81□□□□□ -0.689e-46■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 518.84■□□□□ 0.613e-15■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.572e-12■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.32e-12■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 KRT18-206ENST00000549078 2088 ntTSL 522.08■■□□□ 1.132e-12■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.072e-12■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 KRT18-205ENST00000548496 695 ntTSL 214.22□□□□□ -0.132e-12■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.821e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ATP2A2-203ENST00000377685 5702 ntTSL 523.7■■□□□ 1.383e-17■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.773e-17■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.363e-17■□□□□ 11.2
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PABPC4Q13310 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.561e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ATP2A2-202ENST00000313432 5575 ntTSL 1 (best)9.38□□□□□ -0.913e-17■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.991e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 28.59□□□□□ -1.041e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.091e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ATP2A2-212ENST00000553144 264 ntTSL 1 (best)5.13□□□□□ -1.593e-17■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.024e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 HSPH1-206ENST00000602786 3488 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.014e-9■□□□□ 11.2
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PABPC4Q13310 HSPH1-209ENST00000630972 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.594e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 HSPH1-203ENST00000435381 812 ntTSL 45.52□□□□□ -1.534e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.621e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.621e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.561e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DCTN3-206ENST00000421919 687 ntTSL 222.8■■□□□ 1.241e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.241e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.11e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.036e-36■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.756e-36■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DTYMK-202ENST00000400770 1089 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.741e-6■□□□□ 11.2
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PABPC4Q13310 DCTN3-208ENST00000472418 688 ntTSL 212.06□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DYNLL1-202ENST00000392508 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.556e-36■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 GTF3C2-206ENST00000454704 1440 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.572e-18■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DCTN3-210ENST00000479399 3023 ntTSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.121e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 DYNLL1-210ENST00000552316 670 nt6.26□□□□□ -1.416e-36■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CCT5-203ENST00000503026 1933 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.243e-10■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-10■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.377e-12■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 FAF1-204ENST00000487898 681 ntTSL 34.77□□□□□ -1.652e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 COX7B-201ENST00000373335 497 ntTSL 24.5□□□□□ -1.693e-10■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CORO1C-210ENST00000549384 891 ntTSL 521.63■■□□□ 1.055e-11■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.825e-11■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 CORO1C-206ENST00000546705 577 ntTSL 315.8■□□□□ 0.125e-11■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SRSF2-210ENST00000589919 595 ntTSL 27.82□□□□□ -1.164e-51■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 THUMPD1-206ENST00000636554 2567 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 THUMPD1-201ENST00000381337 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 PRDX2-204ENST00000477555 699 ntTSL 213.13□□□□□ -0.317e-8■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 RACK1-223ENST00000510199 1100 ntTSL 313.87□□□□□ -0.194e-61■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 RACK1-214ENST00000507000 685 ntTSL 58.36□□□□□ -1.074e-61■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.761e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 RTL8C-202ENST00000464369 616 ntTSL 512.2□□□□□ -0.461e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 PPDPF-204ENST00000473620 478 ntTSL 222.92■■□□□ 1.266e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.546e-9■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SELENOW-211ENST00000599874 636 ntTSL 219.67■□□□□ 0.747e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.321e-16■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.391e-16■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.551e-16■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.571e-16■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.591e-16■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SELENOW-206ENST00000598273 2437 ntTSL 219.96■□□□□ 0.794e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SELENOW-213ENST00000601419 717 ntTSL 219.48■□□□□ 0.714e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.384e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.184e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.134e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SELENOW-207ENST00000598956 1032 ntTSL 215.33■□□□□ 0.044e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SELENOW-214ENST00000601937 674 ntTSL 211.52□□□□□ -0.574e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 SELENOW-215ENST00000602163 2503 nt10.99□□□□□ -0.654e-7■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.194e-6■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.445e-15■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.095e-15■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.985e-15■□□□□ 11.2
PABPC4Q13310 REXO2-204ENST00000538791 1081 ntTSL 213.62□□□□□ -0.235e-15■□□□□ 11.2
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