Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms