Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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KCNMA1Q12791 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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KCNMA1Q12791 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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KCNMA1Q12791 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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KCNMA1Q12791 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNMA1Q12791 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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KCNMA1Q12791 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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