Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IFFO1Q0D2I5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFFO1Q0D2I5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms