Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms