Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB4P54760 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB4P54760 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms