Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTSCP53634 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSCP53634 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSCP53634 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSCP53634 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms