Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
COPAP53621 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
COPAP53621 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
COPAP53621 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COPAP53621 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COPAP53621 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPAP53621 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COPAP53621 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms