Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CRIP1P50238 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms