Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ME1P48163 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ME1P48163 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ME1P48163 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ME1P48163 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms