Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL1P40616 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL1P40616 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms